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RDV le jeudi 28 septembre 2023, de 08h00 à 09h00 ! En présentiel ou en distanciel pour le prochain staff de corrélations radio-pathologiques (2 cas présentés) : « Les ischémies mésentériques veineuses (suite de la session du jeudi 13 avril 2023) ».

Intervenants : Dr Dominique Cazals Hatem (pathologiste) et Dr Jules Grégory (radiologue).
Modérateur : Pr Olivier Corcos.

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Un Enseignement Complémentaire Obligatoire (ECO) de radio-pathologie sera disponible à partir du 04 janvier 2023 avec comme objectif d’améliorer l’apprentissage transversal de l’imagerie radiologique et pathologique en mettant l’accent sur l’importance de la coopération entre les différentes disciplines d’imagerie dans la démarche diagnostique et la prise en charge des patients, au cours d’un enseignement interactif, ainsi qu’une initiation à l’intelligence artificielle.

Cette approche combinée radio/anatomopathologique n’est pas développée dans l’enseignement par spécialité. Il n’est pas nécessaire d’avoir étudié toutes pathologies d’organe qui seront présentées pour profiter de cet enseignement, qui vous permettra au contraire de les approcher au mieux.

La fiche résumé ECO radio-pathologie

D’où vient l’idée ?

Imaginée par Nathalie SIAUVE (Directrice du DMU DREAM et radiologue, PU-PH à Louis Mourier) et Séverine MOYNAT (Cadre paramédical du DMU DREAM) la plateforme a pour vocation de partager les connaissances et de mutualiser les savoir-faire présents au sein du DMU.

Partage ton DREAM a été pensé pour l’ensemble du personnel du DMU DREAM, dans le but de leur offrir accès à davantage de formations et d’information. Dès le début, le personnel du DMU a été impliqué dans la conception de la plateforme pour s’assurer qu’elle réponde à des besoins concrets et actuels.

Le nom de la plateforme

Le nom de la plateforme répond lui aussi à cette idée d’ouverture et d’implication du personnel dans la vie de la plateforme. En effet, il a été trouvé par un manipulateur en électroradiologie du service de radiologie à Saint-Louis.

Tout en reprenant l’intitulé du DMU : « DREAM » (pour rappel : Diagnostic, Radiologie, Explorations fonctionnelles, Anatomopathologie, Médecine nucléaire), il évoque cette notion clé du projet : le partage.

La 2^ème édition du « Workshop Women in Science » (WiS) by FHUs dont la thématique sera « Santé des Femmes et Femmes de Santé » aura lieu :

• Le vendredi 15 décembre 2023, de 13h30 à 17h30.
• À l’Hôpital Européen Georges Pompidou (AP-HP), 20 Rue Leblanc – 75015 Paris.

La FHU MOSAIC représentée par le Pr Valérie Paradis fera partie des parrains et des modératrices de cette nouvelle édition !

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PRÉDICTION DE L’INVASION VASCULAIRE MICROSCOPIQUE PAR IMAGOMICS ET DIMENSION FRACTALE DANS LE CARCINOME HÉPATOCELLULAIRE

DURÉE
2022-2023

MONTANT LEVÉ
Non applicable

STAGE
Partenariat AP-HP/EPITA

Ce projet fait l’objet d’un stage de 6 mois (Jake Penney, 2022) porté par la FHU Mosaic au sein du partenariat entre l’AP-HP et l’école d’ingénieur informatique EPITA.

L’objectif est d’identifier les caractéristiques morphologiques pertinentes basées sur la FD de la microvascularisation tumorale permettant de prédire l’IVm dans le CHC, et étudier la relation entre la FD en fonction de l’échelle spatiale et les images pertinentes fournies par l’IRM ou la tomodensitométrie améliorée par contraste. Cela permettra d’identifier les patients à risque d’invasion tumorale et de stratifier le traitement.

Les carcinomes hépatocellulaires (CHC) sont des tumeurs de mauvais pronostic principalement en raison de la présence d’une invasion microvasculaire (IVm), un critère morphologique uniquement évalué sur les pièces chirurgicales. L’identification de ce critère le plus tôt possible, sur l’imagerie des échantillons de biopsie, améliorerait considérablement la prise en charge et le résultat des patients. Nous émettons l’hypothèse que la dimension fractale (DF) reflétant la désorganisation spatiale vasculaire, est prédictive de l’IVm.

STAGE
Partenariat AP-HP/INRIA
Durée
2022-2023
Montant levé
5 000€

Ce projet fait l’objet d’un stage de 6 mois (Paul-Émile Zafar, 2022) porté par la FHU Mosaic au sein du partenariat entre l’AP-HP et l’INRIA : « Bernouilli_Lab ». La FHU Mosaic a profité de cette initiative du laboratoire commun Bernouilli pour être mis en relation avec l’équipe Inria OPIS (« OPtImization for large Scalebiomedical data ») du Centre de Vision Numérique de CentraleSupélec. Ce projet est donc en collaboration avec Jean-Christophe Pesquet, chef de l’équipe OPIS, sur la partie intelligence artificielle. Ce projet fait également l’objet d’une bourse auprès de la société européenne de radiologie gastro-intestinale et abdominale.

L’objectif de cette étude est d’appliquer diverses méthodes d’apprentissage faiblement supervisées basées sur des réseaux neuronaux convolutifs profonds (CNN) pour classer ces cancers primaires du foie à l’aide de l’imagerie multiéchelle (radiologie, anatomopathologie).

Les cancers primitifs du foie sont la 4e cause de décès par cancer dans le monde, avec une incidence croissante dans la plupart des pays occidentaux. Ils constituent un groupe hétérogène de tumeurs associées à des facteurs de risque, des résultats cliniques et des caractéristiques d’imagerie, histologiques et moléculaires distincts. Parmi ces tumeurs, le carcinome hépatocellulaire (CHC) et le cholangiocarcinome intrahépatique (iCCA) sont de loin les plus courants et représentent les deux extrémités du spectre tumoral. Entre les deux, l’hépato-cholangiocarcinome combiné (cCHC-CCA) est reconnu comme une tumeur rare partageant les caractéristiques du CHC et de l’iCCA, dont le pronostic n’est toujours pas clair. Alors que l’imagerie et la biopsie de la tumeur permettent d’obtenir de bons résultats pour le diagnostic précis du CHC et de l’iCCA, les performances diagnostiques du cCHC-CCA basées sur une seule modalité sont faibles. L’analyse histologique représente le gold standard pour le diagnostic du cCHC-CCA, mais même d’un point de vue histologique, ce diagnostic peut être très difficile, en particulier dans les échantillons de biopsie. Récemment, nous avons montré que la combinaison de l’imagerie et de la biopsie de la tumeur pouvait améliorer le diagnostic du CHC-CCA, soulignant l’intérêt d’utiliser des données d’imagerie multi-échelles.

Le projet PICTURE nait de l’idée de développer :

Un Enseignement Complémentaire Obligatoire (ECO) de radio-pathologie  permettant de corréler les 2 disciplines d’imagerie transversales.
Une plateforme de simulation virtuelle pour l’enseignement interdisciplinaire de l’imagerie multimodale intégrant imageries 3D et lames virtuelles.
Cette approche innovante aurait ainsi pour objectifs :

D’améliorer l’apprentissage transversal de l’imagerie radiologique et pathologique.
D’initier les étudiants à la coopération entre différentes disciplines d’imagerie.

Pleinement intégré dans la réforme du 2ème cycle cet ECO permet aux étudiants :

L’apprentissage de la démarche diagnostique en imagerie.
L’amélioration de la compréhension en analyse de l’image.
La découverte de la coopération et l’échange entre les différentes disciplines d’imagerie.
L’introduction à l’utilisation de l’intelligence artificielle en imagerie médicale.
La plateforme de simulation virtuelle est mise à disposition pour les enseignements futurs et déjà existants ainsi que pour la révision des étudiants.

Aurélie Beaufrère, Jules Grégory, Valérie Paradis, Valérie Vilgrain, Jérôme Cros et Kevin Mondet ont fait partie du groupe de travail PICTURE.

En pratique

PUBLIC ET MODALITÉS
Étudiants de DFASM1 – Volume horaire : 15h de cours sur un trimestre.

RESSOURCES MATÉRIELLES
Infrastructure réseau – Outils de visualisation (lames histologiques : cytomine) et imageries radiologiques 3D (OHIF).

CONTRÔLE DES CONNAISSANCES
Présence aux enseignements : 25% de la note finale – Présentation d’un cas radio-pathologique : 75% de la note finale.

https://youtu.be/cH8wVoJkmCQ

https://youtu.be/-y7rDkK7daU

https://youtu.be/w9IEdgWoPms

https://youtu.be/Jm09TySN1OM

Ce projet a été proposé comme projet de fin d’études à l’école d’ingénieur informatique EPITA par la FHU Mosaic.

L’objectif est de contribuer à la création d’un standard en anatomie pathologique : la taille des biopsies. Cette taille doit être adaptée et suffisante afin d’établir un diagnostic et d’évaluer la sévérité de la maladie ainsi qu’à l’application d’un modèle d’IA.

L’analyse histologique repose sur l’examen microscopique des tissus / organes à partir de pièces opératoires ou de biopsies. Elle permet de faire le diagnostic, basé sur des critères morphologiques, microscopiques et moléculaires ainsi que d’appréhender le pronostic Les biopsies, obtenues à partir de prélèvements invasifs faits à l’aiguille (par le clinicien/radiologue), sont des fragments de petite taille (1 à 2 cm de long / 1-3 mm de diamètre) et donc ne reflètent qu’imparfaitement l’ensemble du processus pathologique (sévérité de la maladie, hétérogénéité intra-tumorale, …). Ainsi, la représentativité de la biopsie est un des facteurs limitants qui n’a été que peu explorée dans la littérature, probablement pour des raisons méthodologiques (multiples biopsies) non disponibles. Dans un travail précédent, nous avons évalué la performance de la biopsie hépatique pour évaluer la sévérité des lésions hépatiques au cours de l’infection par le virus de l’hépatite C en fonction de sa longueur en construisant des biopsies virtuelles à partir de résections ou transplantations hépatiques.

Il en est de même pour les modèles d’intelligence artificielle lorsqu’ils sont appliqués à des tumeurs hétérogènes. Il existe 2 grands sous type moléculaire d’adénocarcinome du pancréas qui ne sont déterminable que par séquençage du transcriptome ce qui n’est pas faisable en routine. Les données moléculaires récentes suggèrent qu’une partie des tumeurs sont hétérogènes, pouvant associer les 2 sous types et que cela impacte le pronostic. Il est donc possible qu’une biopsie, si trop petite, n’appréhende pas cette hétérogénéité. Il conviendrait donc d’évaluer la variabilité spatiale de la prédiction sur des biopsies virtuelles issues de pièces opératoires.

AP-HP

• AP-HP – Nord – Université Paris Cité :
  • DMU DREAM (service d’anatomie pathologique).

Inserm

• U1149 CRI – INDiD.

École d’ingénieur

• EPITA

Merci à tous les orateurs, parrains et participants d’avoir contribué à la réussite de la 1^ère édition de MOSAIC’ Day, le jeudi 06 avril 2023, sur le Campus Picpus (AP-HP).

De la présentation de la FHU MOSAIC par le Pr Valérie Paradis, à la remise des prix aux jeunes chercheurs, dans le cadre de l’appel à communications, par le Pr Valérie Vilgrain, en passant par les présentations des orateurs, experts en oncologie, en imagerie médicale et en intelligence artificielle : vous pouvez dès à présent visionner les replays !

Dans un souci constant d’amélioration et afin de préparer dès à présent la 2^ème édition, nous souhaiterions aussi recueillir vos impressions sur cette 1^ère édition de la MOSAIC’ Day.

Merci par avance de prendre quelques minutes pour nous donner votre avis et vos suggestions, en répondant à notre questionnaire (anonyme) en ligne !

Quoi ?

Le Pr Valérie Vilgrain, Hôpital Beaujon (AP-HP)  et le Dr Marc Zins Hôpital Saint-Joseph (AP-HP) organisent le 41^ème Séminaire Radiologique de l’hôpital Beaujon « Savoir-faire en imagerie abdominale et digestive ».

Où ? 

Hôpital Beaujon (AP-HP) – 100 boulevard du Général Leclerc – 92110 Clichy Cedex.
Les cours : amphithéâtre de l’IFSI.
Les ateliers pratiques : service d’imagerie médicale (1^er étage du bâtiment principal).

Quand ?  

Le vendredi 10 mars 2023, de 08h30 à 18h.
Le samedi 11 mars 2023, de 08h45 à 16h15.

Comment ? 

• Le but de ces deux journées d’enseignements, animées par les équipes de l’hôpital Beaujon et de l’hôpital Saint-Joseph, est l’acquisition des bases théoriques et pratiques indispensables à la réalisation et à l’interprétation des examens d’imagerie en pathologie abdominale et digestive.
• Les exposés aborderont à la fois les problèmes techniques et diagnostiques.
• L’imagerie pronostique du CHC et l’imagerie des cystadénomes séreux du pancréas feront l’objet d’une mise au point.
• L’imagerie des lésions rectales atypiques sera détaillée.
• L’apport en pratique courante de l’élastographie hépatique au-delà de la fibrose sera discutée.
• Une mise au point sera consacrée au diagnostic des sténoses du hile hépatique.
• Des observations commentées, sélectionnées pour leur caractère didactique, ponctueront les exposés classiques pendant la matinée.
• Les 2 après-midis seront consacrées aux enseignements dirigés, après répartition en petits groupes de huit à dix participants (il s’agira exclusivement de séances d’étude de dossiers, dont le but est de replacer chacun dans le cadre de sa pratique quotidienne).

En savoir plus 

Tarifs
550€ (médecins) – 200€ (internes et CCA en exercice, sur justificatif).
Les droits d’inscription comprennent l’accès aux cours et aux ateliers, ainsi que les temps de convivialité.
Le nombre d’inscriptions est limité à 75 participants.
Les règlements se font à l’ordre de l’Association Beaujonaise de Recherche en Imagerie (ABRI), par chèque ou par virement bancaire.

Téléchargement
Programme et bulletin d’inscription

Contact
Marie-Noëlle Riquier – Assistante du Pr Valérie Vilgrain – Service d’imagerie médicale.
Tél. : 01 40 87 53 58 – E-mail : marie-noelle.riquier@aphp.fr

Dans le cadre d’un partenariat entre l’Inserm et le CNRS, chaque année, une vingtaine de jeunes chercheurs et chercheuses constituent leur propre équipe de recherche dans les domaines des sciences de la vie et de la santé : il s’agit du programme Atip-Avenir !

Ce programme a déjà bénéficié à plus de 400 scientifiques prometteurs et prometteuses, dont Rémy Nicolle, lauréat en 2022, avec son travail en recherche translationnelle, qui combine génomique, transcriptomique et intelligence artificielle.

Dans un article de l’Inserm Rémy Nicolle expose le lien entre la diversité de la structure et de la composition des cancers du pancréas et les avancées en matière d’innovation thérapeutique : chercher à comprendre et à caractériser l’hétérogénéité de ces tumeurs permettra aux patients de disposer rapidement de nouveaux traitements.

Rémy Nicolle est responsable de l’équipe génomique translationnelle de l’hétérogénéité des néoplasies pancréatiques GeNeHetX au Centre de Recherche sur l’Inflammation (Unité 1149 Inserm/Université Paris-Cité), à Paris. En janvier 2022, Rémy et son équipe sont également venus renforcer l’expertise en bio-informatique et génomique des cancers pancréatiques de la FHU MOSAIC.